Le CICR a ouvert un bureau à Nouakchott en 2005. Il visite des personnes privées de liberté dans l'ensemble du pays. Ces visites concernent notamment des détenus accusés d'atteinte à la sûreté de l'État, et ont été étendues, en 2007, aux lieux de garde à vue. Elles permettent, entre autres choses, aux détenus et à leur famille d'échanger des nouvelles. Elles sont aussi l'occasion de notifier la présence de détenus étrangers à leurs représentations diplomatiques respectives en Mauritanie.

Depuis 2007, le CICR visite régulièrement le centre de transit de Nouadhibou, au nord de Nouakchott, qui accueille des migrants en attente d'être reconduits vers le Sénégal ou le Mali.